Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a4Q9JIS8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a4Q9JIS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a4Q9JIS8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a4Q9JIS8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a4Q9JIS8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a4Q9JIS8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc12a4Q9JIS8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc12a4Q9JIS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc12a4Q9JIS8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc12a4Q9JIS8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc12a4Q9JIS8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc12a4Q9JIS8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms