Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA9

Ctsr, Cathepsin R, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsrQ9JIA9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtsrQ9JIA9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtsrQ9JIA9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CtsrQ9JIA9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CtsrQ9JIA9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtsrQ9JIA9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtsrQ9JIA9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtsrQ9JIA9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.8 ms