Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a3r2Q9JHL1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9a3r2Q9JHL1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc9a3r2Q9JHL1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc9a3r2Q9JHL1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9a3r2Q9JHL1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms