Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc5a4aQ9ET37 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Slc5a4aQ9ET37 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc5a4aQ9ET37 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc5a4aQ9ET37 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc5a4aQ9ET37 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc5a4aQ9ET37 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc5a4aQ9ET37 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc5a4aQ9ET37 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc5a4aQ9ET37 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc5a4aQ9ET37 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4aQ9ET37 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc5a4aQ9ET37 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc5a4aQ9ET37 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc5a4aQ9ET37 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc5a4aQ9ET37 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc5a4aQ9ET37 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc5a4aQ9ET37 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Slc5a4aQ9ET37 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc5a4aQ9ET37 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc5a4aQ9ET37 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc5a4aQ9ET37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms