Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim2Q9ESN6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim2Q9ESN6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim2Q9ESN6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim2Q9ESN6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim2Q9ESN6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim2Q9ESN6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim2Q9ESN6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms