Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1ql3Q9ESN4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1ql3Q9ESN4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1ql3Q9ESN4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1ql3Q9ESN4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1ql3Q9ESN4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.7 ms