Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc28a3Q9ERH8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc28a3Q9ERH8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc28a3Q9ERH8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc28a3Q9ERH8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc28a3Q9ERH8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms