Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tfip11Q9ERA6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tfip11Q9ERA6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tfip11Q9ERA6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Tfip11Q9ERA6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tfip11Q9ERA6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tfip11Q9ERA6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tfip11Q9ERA6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms