Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER97

Ngb, Neuroglobin, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgbQ9ER97 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NgbQ9ER97 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NgbQ9ER97 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NgbQ9ER97 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NgbQ9ER97 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NgbQ9ER97 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NgbQ9ER97 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NgbQ9ER97 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NgbQ9ER97 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NgbQ9ER97 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NgbQ9ER97 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgbQ9ER97 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NgbQ9ER97 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NgbQ9ER97 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NgbQ9ER97 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NgbQ9ER97 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NgbQ9ER97 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NgbQ9ER97 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NgbQ9ER97 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NgbQ9ER97 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NgbQ9ER97 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms