Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Clstn2Q9ER65 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Clstn2Q9ER65 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Clstn2Q9ER65 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Clstn2Q9ER65 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Clstn2Q9ER65 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Clstn2Q9ER65 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Clstn2Q9ER65 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Clstn2Q9ER65 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Clstn2Q9ER65 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Clstn2Q9ER65 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Clstn2Q9ER65 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Clstn2Q9ER65 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Clstn2Q9ER65 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Clstn2Q9ER65 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Clstn2Q9ER65 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Clstn2Q9ER65 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Clstn2Q9ER65 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Clstn2Q9ER65 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Clstn2Q9ER65 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Clstn2Q9ER65 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Clstn2Q9ER65 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Clstn2Q9ER65 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Clstn2Q9ER65 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Clstn2Q9ER65 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Clstn2Q9ER65 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Clstn2Q9ER65 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Clstn2Q9ER65 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Clstn2Q9ER65 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Clstn2Q9ER65 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Clstn2Q9ER65 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Clstn2Q9ER65 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Clstn2Q9ER65 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Clstn2Q9ER65 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Clstn2Q9ER65 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Clstn2Q9ER65 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Clstn2Q9ER65 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Clstn2Q9ER65 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Clstn2Q9ER65 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Clstn2Q9ER65 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms