Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capn12Q9ER56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Capn12Q9ER56 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Capn12Q9ER56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Capn12Q9ER56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capn12Q9ER56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Capn12Q9ER56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capn12Q9ER56 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capn12Q9ER56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms