Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ropn1lQ9EQ00 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ropn1lQ9EQ00 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ropn1lQ9EQ00 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ropn1lQ9EQ00 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ropn1lQ9EQ00 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms