Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ftsj3Q9DBE9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ftsj3Q9DBE9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ftsj3Q9DBE9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ftsj3Q9DBE9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ftsj3Q9DBE9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ftsj3Q9DBE9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ftsj3Q9DBE9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ftsj3Q9DBE9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ftsj3Q9DBE9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ftsj3Q9DBE9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ftsj3Q9DBE9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ftsj3Q9DBE9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ftsj3Q9DBE9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ftsj3Q9DBE9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms