Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA9

Gtf2h1, General transcription factor IIH subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h1Q9DBA9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2h1Q9DBA9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2h1Q9DBA9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2h1Q9DBA9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2h1Q9DBA9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2h1Q9DBA9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2h1Q9DBA9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2h1Q9DBA9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2h1Q9DBA9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf2h1Q9DBA9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2h1Q9DBA9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2h1Q9DBA9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2h1Q9DBA9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2h1Q9DBA9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2h1Q9DBA9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2h1Q9DBA9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2h1Q9DBA9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2h1Q9DBA9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf2h1Q9DBA9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2h1Q9DBA9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2h1Q9DBA9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2h1Q9DBA9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2h1Q9DBA9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2h1Q9DBA9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2h1Q9DBA9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2h1Q9DBA9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2h1Q9DBA9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf2h1Q9DBA9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2h1Q9DBA9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2h1Q9DBA9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2h1Q9DBA9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2h1Q9DBA9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms