Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med29Q9DB91 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med29Q9DB91 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med29Q9DB91 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med29Q9DB91 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med29Q9DB91 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med29Q9DB91 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Med29Q9DB91 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med29Q9DB91 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med29Q9DB91 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med29Q9DB91 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med29Q9DB91 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med29Q9DB91 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms