Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAJ8

1700008P02Rik, MCG13911, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700008P02RikQ9DAJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700008P02RikQ9DAJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700008P02RikQ9DAJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700008P02RikQ9DAJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700008P02RikQ9DAJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700008P02RikQ9DAJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700008P02RikQ9DAJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
1700008P02RikQ9DAJ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700008P02RikQ9DAJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700008P02RikQ9DAJ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms