Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700012A03RikQ9DAF1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700012A03RikQ9DAF1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700012A03RikQ9DAF1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700012A03RikQ9DAF1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700012A03RikQ9DAF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms