Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sgf29Q9DA08 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sgf29Q9DA08 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sgf29Q9DA08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sgf29Q9DA08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sgf29Q9DA08 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms