Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pradc1Q9D9N8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pradc1Q9D9N8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pradc1Q9D9N8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms