Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem41aQ9D8U2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem41aQ9D8U2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem41aQ9D8U2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem41aQ9D8U2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem41aQ9D8U2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem41aQ9D8U2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms