Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mrpl17Q9D8P4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mrpl17Q9D8P4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mrpl17Q9D8P4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl17Q9D8P4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl17Q9D8P4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mrpl17Q9D8P4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mrpl17Q9D8P4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mrpl17Q9D8P4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms