Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan13Q9D8C2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspan13Q9D8C2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan13Q9D8C2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan13Q9D8C2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan13Q9D8C2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms