Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chmp4cQ9D7F7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chmp4cQ9D7F7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chmp4cQ9D7F7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chmp4cQ9D7F7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Chmp4cQ9D7F7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chmp4cQ9D7F7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chmp4cQ9D7F7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chmp4cQ9D7F7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chmp4cQ9D7F7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chmp4cQ9D7F7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms