Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T2

4921524L21Rik, MCG15536, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921524L21RikQ9D5T2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4921524L21RikQ9D5T2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4921524L21RikQ9D5T2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4921524L21RikQ9D5T2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4921524L21RikQ9D5T2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4921524L21RikQ9D5T2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4921524L21RikQ9D5T2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
4921524L21RikQ9D5T2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4921524L21RikQ9D5T2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4921524L21RikQ9D5T2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
4921524L21RikQ9D5T2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4921524L21RikQ9D5T2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
4921524L21RikQ9D5T2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4921524L21RikQ9D5T2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4921524L21RikQ9D5T2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4921524L21RikQ9D5T2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
4921524L21RikQ9D5T2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4921524L21RikQ9D5T2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
4921524L21RikQ9D5T2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
4921524L21RikQ9D5T2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
4921524L21RikQ9D5T2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4921524L21RikQ9D5T2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms