Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zcchc13Q9D548 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zcchc13Q9D548 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc13Q9D548 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc13Q9D548 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zcchc13Q9D548 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc13Q9D548 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms