Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tomm20lQ9D4V6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tomm20lQ9D4V6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tomm20lQ9D4V6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tomm20lQ9D4V6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tomm20lQ9D4V6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms