Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf128Q9D304 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf128Q9D304 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf128Q9D304 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf128Q9D304 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf128Q9D304 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf128Q9D304 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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