Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2v1Q9CZY3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2v1Q9CZY3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2v1Q9CZY3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2v1Q9CZY3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms