Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU6

Cs, Citrate synthase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsQ9CZU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CsQ9CZU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CsQ9CZU6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CsQ9CZU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CsQ9CZU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CsQ9CZU6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CsQ9CZU6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CsQ9CZU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CsQ9CZU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CsQ9CZU6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CsQ9CZU6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CsQ9CZU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CsQ9CZU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CsQ9CZU6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CsQ9CZU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CsQ9CZU6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CsQ9CZU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CsQ9CZU6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CsQ9CZU6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms