Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MtrexQ9CZU3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MtrexQ9CZU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MtrexQ9CZU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtrexQ9CZU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtrexQ9CZU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MtrexQ9CZU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MtrexQ9CZU3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MtrexQ9CZU3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MtrexQ9CZU3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MtrexQ9CZU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MtrexQ9CZU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MtrexQ9CZU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MtrexQ9CZU3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MtrexQ9CZU3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MtrexQ9CZU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MtrexQ9CZU3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MtrexQ9CZU3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MtrexQ9CZU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MtrexQ9CZU3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MtrexQ9CZU3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtrexQ9CZU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.8 ms