Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shmt2Q9CZN7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shmt2Q9CZN7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shmt2Q9CZN7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shmt2Q9CZN7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shmt2Q9CZN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shmt2Q9CZN7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms