Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bud23Q9CY21 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bud23Q9CY21 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bud23Q9CY21 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bud23Q9CY21 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bud23Q9CY21 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bud23Q9CY21 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms