Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc17Q9CXD9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc17Q9CXD9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc17Q9CXD9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc17Q9CXD9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc17Q9CXD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc17Q9CXD9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc17Q9CXD9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc17Q9CXD9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc17Q9CXD9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc17Q9CXD9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc17Q9CXD9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc17Q9CXD9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc17Q9CXD9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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