Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpusd4Q9CWX4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd4Q9CWX4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms