Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tubb2bQ9CWF2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tubb2bQ9CWF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubb2bQ9CWF2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubb2bQ9CWF2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubb2bQ9CWF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubb2bQ9CWF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubb2bQ9CWF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms