Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc43Q9CR29 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc43Q9CR29 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc43Q9CR29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc43Q9CR29 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc43Q9CR29 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc43Q9CR29 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc43Q9CR29 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc43Q9CR29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms