Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931417E11RikQ9CR05 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931417E11RikQ9CR05 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931417E11RikQ9CR05 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4931417E11RikQ9CR05 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931417E11RikQ9CR05 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms