Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk2ap2Q9CPY4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk2ap2Q9CPY4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk2ap2Q9CPY4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk2ap2Q9CPY4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk2ap2Q9CPY4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk2ap2Q9CPY4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms