Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf2ird2Q99NI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2ird2Q99NI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2ird2Q99NI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2ird2Q99NI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2ird2Q99NI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird2Q99NI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf2ird2Q99NI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2ird2Q99NI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms