Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp26Q99MX1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp26Q99MX1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp26Q99MX1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp26Q99MX1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp26Q99MX1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp26Q99MX1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp26Q99MX1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp26Q99MX1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp26Q99MX1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp26Q99MX1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp26Q99MX1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp26Q99MX1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp26Q99MX1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp26Q99MX1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp26Q99MX1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp26Q99MX1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp26Q99MX1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp26Q99MX1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp26Q99MX1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp26Q99MX1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp26Q99MX1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.1 ms