Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ciao1Q99KN2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ciao1Q99KN2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ciao1Q99KN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ciao1Q99KN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ciao1Q99KN2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ciao1Q99KN2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ciao1Q99KN2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ciao1Q99KN2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms