Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Reep3Q99KK1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Reep3Q99KK1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Reep3Q99KK1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Reep3Q99KK1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Reep3Q99KK1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Reep3Q99KK1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Reep3Q99KK1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Reep3Q99KK1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Reep3Q99KK1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Reep3Q99KK1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Reep3Q99KK1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Reep3Q99KK1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Reep3Q99KK1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Reep3Q99KK1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Reep3Q99KK1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Reep3Q99KK1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Reep3Q99KK1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Reep3Q99KK1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Reep3Q99KK1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Reep3Q99KK1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Reep3Q99KK1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Reep3Q99KK1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Reep3Q99KK1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Reep3Q99KK1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Reep3Q99KK1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Reep3Q99KK1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.9 ms