Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdelr1Q99JH8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdelr1Q99JH8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdelr1Q99JH8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdelr1Q99JH8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdelr1Q99JH8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdelr1Q99JH8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdelr1Q99JH8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kdelr1Q99JH8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdelr1Q99JH8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdelr1Q99JH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdelr1Q99JH8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdelr1Q99JH8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdelr1Q99JH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdelr1Q99JH8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kdelr1Q99JH8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdelr1Q99JH8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdelr1Q99JH8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdelr1Q99JH8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdelr1Q99JH8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdelr1Q99JH8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdelr1Q99JH8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms