Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ophn1Q99J31 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ophn1Q99J31 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ophn1Q99J31 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ophn1Q99J31 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ophn1Q99J31 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ophn1Q99J31 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms