Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Grin3bQ91ZU9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin3bQ91ZU9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin3bQ91ZU9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin3bQ91ZU9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Grin3bQ91ZU9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Grin3bQ91ZU9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin3bQ91ZU9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms