Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Creb3l3Q91XE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Creb3l3Q91XE9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Creb3l3Q91XE9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Creb3l3Q91XE9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Creb3l3Q91XE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Creb3l3Q91XE9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Creb3l3Q91XE9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Creb3l3Q91XE9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Creb3l3Q91XE9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Creb3l3Q91XE9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Creb3l3Q91XE9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Creb3l3Q91XE9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Creb3l3Q91XE9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Creb3l3Q91XE9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Creb3l3Q91XE9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Creb3l3Q91XE9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms