Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tm4sf4Q91XD3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tm4sf4Q91XD3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tm4sf4Q91XD3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tm4sf4Q91XD3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tm4sf4Q91XD3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tm4sf4Q91XD3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tm4sf4Q91XD3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tm4sf4Q91XD3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tm4sf4Q91XD3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tm4sf4Q91XD3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tm4sf4Q91XD3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tm4sf4Q91XD3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tm4sf4Q91XD3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tm4sf4Q91XD3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tm4sf4Q91XD3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tm4sf4Q91XD3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tm4sf4Q91XD3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tm4sf4Q91XD3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tm4sf4Q91XD3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms