Protein–RNA interactions for Protein: Q91XA5

Snapc2, snRNA-activating protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc2Q91XA5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snapc2Q91XA5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Snapc2Q91XA5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Snapc2Q91XA5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Snapc2Q91XA5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snapc2Q91XA5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Snapc2Q91XA5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snapc2Q91XA5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snapc2Q91XA5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Snapc2Q91XA5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snapc2Q91XA5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snapc2Q91XA5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snapc2Q91XA5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snapc2Q91XA5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snapc2Q91XA5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Snapc2Q91XA5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snapc2Q91XA5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snapc2Q91XA5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms