Protein–RNA interactions for Protein: Q91X84

Crtc3, CREB-regulated transcription coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crtc3Q91X84 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crtc3Q91X84 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crtc3Q91X84 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crtc3Q91X84 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crtc3Q91X84 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crtc3Q91X84 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crtc3Q91X84 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Crtc3Q91X84 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crtc3Q91X84 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crtc3Q91X84 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms