Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep1Q91W92 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep1Q91W92 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdc42ep1Q91W92 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep1Q91W92 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdc42ep1Q91W92 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc42ep1Q91W92 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdc42ep1Q91W92 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdc42ep1Q91W92 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdc42ep1Q91W92 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdc42ep1Q91W92 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdc42ep1Q91W92 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdc42ep1Q91W92 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdc42ep1Q91W92 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms